A igreja foi erguida, fora dos muros da cidade, para servir como templo ao Colégio dos Jesuítas, sendo inicialmente construída de taipa, por volta do ano 1587, e posteriormente erguida em alvenaria por Mem de Sá. Após a expulsão da presente Ordem da cidade, a Igreja dos Jesuítas passou a ser a sede da cidade, recebendo o nome de Catedral Basílica de Salvador. [1]
{Citar|nome=Rafaela|sobrenome=Araújo}